Nachdem die Verhandlungen um Schürfrechte mit dem friedliebenden Planeten Halkan gescheitert sind, wollen Captain Kirk und sein Bodenteam auf die Enterprise zurückkehren. Ein Ionensturm stört den Vorgang des Beamens jedoch in solchem Maße, dass das Team in einem Gegenuniversum ankommt.

Zwar gibt es dort auch ein Raumschiff Enterprise, doch steht dieses im Dienste eines barbarischen Imperiums, das im Begriff ist, die Zivilisation des Planeten Halkan auszulöschen. Und während Captain Kirk, Schiffsarzt Dr. McCoy und der Rest des Teams befürchten, in der grausamen Parallelwelt gefangen bleiben zu müssen, verursachen ihre bösen Gegenstücke Probleme auf der echten Enterprise.